يشهد المستشفى الجامعي بقابس ظروفا صعبة للغاية، حيث يعمل قسم الجراحة، بقاعة واحدة من جملة 6 قاعات بالقسم، لا تتوفر فيها المواصفات المطلوبة مما تسبب في تعطيل عمل الأطباء الذين أصبحوا مجبرين على إجراء العمليات الجراحية للحالات المستعجلة فقط دون غيرها، وانعكس سلبا على الخدمات المسداة للمواطنين، وفق ما ذكره به مصدر مسؤول بالمستشفى لوكالة تونس إفريقيا للأنباء.
وانتقد ذات المصدر تواصل تعطّل أشغال مشروع تقوية أسس وإصلاح هياكل ومباني المستشفى الجامعي بقابس التي انطلقت في بداية سنة 2013، وقد تسبّب هذا التعطّل في عمل المستشفى بنصف طاقة استيعابه، خاصة بعد غلق، منذ ما يزيد عن السنتين، 8 قاعات بكل طابق من طوابقه الستة، إلى جانب غلق عياداته الخارجية بغاية إصلاحها